Read Seurat object from Pluto — pluto_read_seurat

Fetches the raw or final Seurat object for a given experiment in Pluto and automatically adds cluster annotation sets to Seurat meta.data if seurat_type=final

Usage

pluto_read_seurat_object(experiment_id, seurat_type, silent = FALSE)

Arguments

experiment_id: Pluto experiment ID
seurat_type: Seurat type, choices are "raw" or "final"
silent: Boolean, whether to suppress console messages

Value

Requested Seurat object; if seurat_type=final, also returns custom cluster color palettes