Fetches the raw or final Seurat object for a given experiment in Pluto and
automatically adds cluster annotation sets to Seurat meta.data if seurat_type=final
Usage
pluto_read_seurat_object(experiment_id, seurat_type, silent = FALSE)
Arguments
- experiment_id
Pluto experiment ID
- seurat_type
Seurat type, choices are "raw" or "final"
- silent
Boolean, whether to suppress console messages
Value
Requested Seurat object; if seurat_type=final, also returns custom cluster color palettes